Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bace2Q9JL18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace2Q9JL18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace2Q9JL18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180 ms