Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmod2Q9JKK7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmod2Q9JKK7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod2Q9JKK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod2Q9JKK7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms