Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip1Q9JJ57 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip1Q9JJ57 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms