Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pus3Q9JI38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pus3Q9JI38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms