Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM8AQ9HCN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM8AQ9HCN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM8AQ9HCN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms