Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A3Q9HC58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC24A3Q9HC58 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms