Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUDS3Q9H7L9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUDS3Q9H7L9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1244.8 ms