Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS1Q9H2V7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS1Q9H2V7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPNS1Q9H2V7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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