Protein–RNA interactions for Protein: Q9H158

PCDHAC1, Protocadherin alpha-C1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC1Q9H158 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC1Q9H158 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHAC1Q9H158 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC1Q9H158 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms