Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM39BQ9GZU3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM39BQ9GZU3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms