Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLIRPQ9GZT3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms