Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtofQ9ESF1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OtofQ9ESF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms