Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a4bQ9ES61 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms