Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn3Q9ERG2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn3Q9ERG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn3Q9ERG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms