Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spock2Q9ER58 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spock2Q9ER58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spock2Q9ER58 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms