Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3bQ9DA80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph3bQ9DA80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms