Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc103Q9D9P2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc103Q9D9P2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc103Q9D9P2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms