Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr2dQ9D7M8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2dQ9D7M8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2dQ9D7M8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms