Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl40Q9D783 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms