Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc81Q9D5W4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc81Q9D5W4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc81Q9D5W4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms