Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zc2hc1bQ9D534 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zc2hc1bQ9D534 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zc2hc1bQ9D534 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms