Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms