Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4931423N10RikQ9D4J9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms