Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx29Q9D3S3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx29Q9D3S3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx29Q9D3S3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms