Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stag1Q9D3E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stag1Q9D3E6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stag1Q9D3E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stag1Q9D3E6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms