Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Serpinb3bQ9D1Q5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Serpinb3bQ9D1Q5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms