Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D1F3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D1F3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D1F3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D1F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D1F3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D1F3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D1F3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms