Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx56Q9D0R4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx56Q9D0R4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx56Q9D0R4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms