Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Gtf2e1Q9D0D5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gtf2e1Q9D0D5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms