Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm1Q9D067 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm1Q9D067 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm1Q9D067 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms