Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm8Q9CZR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cmtm8Q9CZR4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm8Q9CZR4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm8Q9CZR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms