Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Shisa9Q9CZN4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms