Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChtopQ9CY57 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChtopQ9CY57 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChtopQ9CY57 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms