Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc17Q9CXD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc17Q9CXD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc17Q9CXD9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc17Q9CXD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc17Q9CXD9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc17Q9CXD9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc17Q9CXD9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms