Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx28Q9CWT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx28Q9CWT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms