Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc43Q9CR29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc43Q9CR29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc43Q9CR29 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms