Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rwdd1Q9CQK7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rwdd1Q9CQK7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rwdd1Q9CQK7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms