Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CQC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9CQC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms