Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQ90 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQ90 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQ90 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQ90 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms