Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole4Q9CQ36 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole4Q9CQ36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole4Q9CQ36 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms