Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKD2Q9BZL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD2Q9BZL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms