Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NSD3Q9BZ95 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NSD3Q9BZ95 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSD3Q9BZ95 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms