Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATA16Q9BXB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA16Q9BXB7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA16Q9BXB7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms