Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRA6Q9BX79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRA6Q9BX79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRA6Q9BX79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms