Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF7Q9BWX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF7Q9BWX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF7Q9BWX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms