Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN3Q9BWM7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SFXN3Q9BWM7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFXN3Q9BWM7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms