Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP4Q9BWG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP4Q9BWG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms