Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A23Q9BV35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A23Q9BV35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms