Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAAF1Q9BRP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAAF1Q9BRP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAAF1Q9BRP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms