Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MXRA8Q9BRK3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MXRA8Q9BRK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MXRA8Q9BRK3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms